其核心优势在于通过系统性的优化组合，实现了传统分段运输难以企及的综合效益。它将原本独立的海运、铁路、公路乃至空运等环节无缝衔接，形成一个高效流畅的全程供应链，为货主带来了从操作简化到战略层面的多重价值。
一，最直观的优点是操作流程的简化与责任关系的明确。在传统分段运输中，货主需要分别联系海运公司、铁路部门、卡车车队等多家承运人，处理多份合同、多套单据，并在运输节点疲于奔命地协调衔接。而多式联运模式下，货主只需与多式联运经营人这一单一接口签订一份合同、办理一次委托、支付一笔费用。更重要的是，这位经营人对全程运输承担统一责任，无论货物在哪个区段出问题，货主都只需向其追索，这极大地降低了沟通成本与法律风险。
二，在经济效益方面，多式联运展现出强大的成本优化与效率提升能力。它能够充分发挥不同运输方式的比较优势，例如利用海运的规模经济性承担长途干线运输，再结合铁路的稳定准时或公路的灵活门到门进行末端配送，从而在保证时效的同时，找到总成本最低的最佳路径组合。这种科学的组合不仅直接降低了运费，还通过减少货物在中间环节的停留时间、简化包装要求，间接节约了仓储、包装和管理成本。
三，多式联运还是提升供应链韧性与可靠性的关键策略。当某一条运输路线因天气、拥堵或突发情况中断时，多式联运经营人可以迅速启动备选方案，灵活调整运输路径，确保物流大动脉的畅通。这种灵活性使得整个供应链能够更好地应对不确定性。同时，借助先进的信息技术，货主可以对集装箱的位置和状态进行全程可视化追踪，实现了从“黑箱”操作到透明化管理的飞跃。
四，从更广阔的视角看，多式联运还具有显著的绿色环保价值。通过将长途干线运输尽可能地向能耗更低、排放更少的铁路和水运转移，它有效减少了整个物流体系的碳排放与环境污染。例如，同等运量下，铁路的碳排放远低于公路运输。这使得选择多式联运不仅是经济决策，也成为一种富有社会责任感的选择。
多式联运的优点超越了简单的运输范畴，它通过集成化、智能化的管理，为企业构建了更经济、更可靠、更透明且更具可持续性的物流体系。它让全球供应链变得不再冗长和脆弱，而是成为支撑企业市场竞争力的坚实基石。
